มัสยิดฮารูณ เป็นมัสยิดเก่าแก่ที่สันนิฐานว่าก่อสร้างมานานกว่า 100 ปี ตั้งอยู่ในบริเวณชุมชนมัสยิดฮารูณ มัสยิดเดิมเป็นเรือนไม้หลังเล็กๆ ต่อมาได้มีการสร้างขึ้นใหม่เป็นอาคาร 2 ชั้นโดยท่านโต๊ะฮารูณ ซึ่งเป็นโต๊ะอิหม่ามคนแรก ซึ่งตอนั้นได้ใช้ชื่อมัสยิดวัดม่วงแค (เนื่องจากอยู่ติดกับวัดม่วงแค) ต่อมาจึงเปลี่ยนชื่อเป็นมัสยิดฮารูณ เพื่อเป็นเกียรติแก่ท่านโต๊ะฮารูณ
ภายในอาคารบริเวณชั้น 2 ตกแต่งอย่างเรียบง่ายแต่สวยงามด้วยสีเขียวและสีแดง ประกอบด้วยมิมบัร (ที่สำหรับแสดงธรรม) และเมียะห์รอบ (ที่สำหรับอิหม่ามนำละหมาด) ส่วนด้านบนรอบโถงมีลายอักษรอาหรับ เป็นบทแรกในพระคัมร์อัลกุรอาน เหนือมิมบัรประดับด้วยโคมไฟที่ได้รับพระราชทานจากพระบาทสมเด็จพระมงกุฎเกล้าเจ้าอยู่หัว นอกจากนี้สมเด็จพระบรมโอรสาธิราชสยามมกุฏราชกุมาร ได้เสด็จพระราชดำเนินทรงเยี่ยมมัสยิดฮารูณ และสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา สยามบรมราชกุมารีทรงเสด็จร่วมพิธีฝังศพจุฬาราขมตรี ต่วน สุวรรณศาสน์
บริเวณด้านหน้าของมัสยิดมีกุโบร (สุสาน) ซึ่งเป็นที่ฝังศพของบุคคลสำคัญ เช่น ท่่านจุฬาราชมนตรี ต่วน สุวรรณศาสน์ รวมทั้งนายทหารจากสงครามเกาหลีและสงครามเวียดนาม มัสยิดฮารูณนอกจากจะใช้เป็นสถานที่ประกอบพิธีทางศาสนาของชุมชนมุสลิฮารูณและชาวมุสลิมทั่วไปแล้ว ยังมีทั้งชาวต่างชาติรวมถึงประเทศในกลุ่มอาหรับก็ได้มาร่วมปฏิบัติศาสนกิจอยู่เสมอรวมถึงยังได้ต้อนรับบุคคลสำคัญจากต่างประเทศอีกมากมาย