โรงเรียน ธรรมวิทยามูลนิธิ ยะลา ตั้งอยู่บ้านเลขที่ 762 ถนนสิโรรส อำเภอเมือง จังหวัดยะลา เดิมเป็นโรงเรียนราษฏ์สอนศาสนาอิสลาม ( ปอเนาะ ) เพียงอย่างเดียว ปัจจุบันเปลี่ยนเป็น โรงเรียนเอกชนสอนศาสนาอิสลาม สอนทั้งวิชาศาสนาและสามัญ ขณะเริ่มเปิดดำเนินการนั้น โรงเรียนยังไม่มีที่ดินและอาคารเรียนเป็นของตนเองต้องอาศัยโรงยางหลัง สุเหร่าบ้านกำปงบารู เป็นสถานที่เรียนs * ปี พ.ศ. 2494 นายหะยีมูฮำหมัดตอเฮร์ สุหลง ได้อุทิศที่ดิน 7 ไร่ 3 งาน 45 ตารางวา ตั้งอยู่ที่กิโลเมตรที่ 1 ติดถนนสายยะลา - ปัตตานี (ที่ตั้งโรงเรียนปัจจุบัน ) ให้แก่โรงเรียน และด้วยความร่วมมือของพี่น้องประชาชนของหมู่บ้านนี้เอง ได้ช่วยกันก่อสร้างอาคารเรียนขึ้นในที่ดินดังกล่าว การเรียนการสอนในระยะเริ่มต้นยังไม่มีระบบเหมือนปัจจุบัน กล่าวคือยังไม่เป็นชั้นเรียน ไม่มีหลักสูตร ผู้บริหารขาดประสบการณ์ ในปัจจุบัน ได้มีผู้บริจาคที่ดินให้แก่โรงเรียนเพิ่มขึ้น รวมเนื้อที่ทั้งหมดได้ประมาณ 11 ไร่เศษ ต่อมานายหะยีฮารน สุหลง ได้เข้ามาเป็นผู้ดำเนินการจัดสรรระบบการเรียนการสอนภายในโรงเรียน ตามที่เห็นสมควร ระยะแรกเปิดรับเฉพาะนักเรียนชายเข้าเรียน ต่อมาเปิดรับนักเรียนหญิง โดยแยกเป็น 2 โรงเรียน คือ โรงเรียนธรรมวิทยามูลนิธิและโรงเรียนสตรีอิสลามวิทยามูลนิธิ เป็นสอนวิชาศาสนาเพียงอย่างเดียว * ปี พ.ศ. 2506 นายหะยีมูฮำหมัดตอเฮร์ สุหลง ได้เข้ามามอบให้นายฮารน เตาฟิก นายนิวัฒ์ ชาจิตตะ และนายหะยีเฮง ตอฮา ยื่นคำร้องต่อทางราชการเพื่อขอจัดตั้งเป็นมูลนิธิขึ้น เรียกว่า “ อิสลามวิทยามูลนิธิ” และได้รับอนุญาตในกลางปีนั่นเอง นายหะฮารน สุหลง ได้รับการแต่งตั้งให้เป็นครูใหญ่ และผู้จัดการโรงเรียนและได้ยกทรัพย์ทั้งหมดของโรงเรียนให้อยู่ในความควบคุม ดูแล และรับผิดชอบของมูลนิธิ มูลนิธิจึงเป็นผู้บริหารโรงเรียนในรูปของคณะกรรการ จึงได้มีการปรับปรุงการเรียนการสอนตั้งแต่บัดนั้นเป็นตนมา