เจดีย์เจ็ดยอด ลักษณะคล้ายกับมหาวิหารโพธิที่พุทธคยาในประเทศอินเดีย ที่ฐานเจดีย์ประดับปูนปั้นรูปเทวดา ด้านนอกพระเจดีย์ก็เช่นกันประดับงานปูนปั้นรูปเทวดาทั้งนั่งขัดสมาธิและยืนทรงเครื่องที่มีลวดลายต่างกันไปดูงามน่าชม สถูปเจดีย์พระเจ้าติโลกราช เมื่อพระเจ้าติโลกราชสวรรคตในปี พ.ศ.2030 พระยอดเชียงราย ราชนัดดาได้สืบราชสมบัติแทน และโปรดให้สร้างสถูปใหญ่บรรจุอัฐิของพระอัยกาธิราช และ สัตตมหาสถาน คือสถานที่สำคัญในพุทธประวัติเจ็ดแห่ง ได้แก่ โพธิบัลลังก์ อนิมิตเจดีย์ รัตนจงกรมเจดีย์ รัตนฆรเจดีย์ อชปาลนิโครธเจดีย์ ราชายตนเจดีย์ ปัจจุบันเหลืออยู่ที่วัดเจ็ดยอดเพียงสามแห่ง คือ อนิมิตเจดีย์ รัตนฆรเจดีย์ มุจจลินทเจดีย์
ชั้นบนขององค์พระเจดีย์เจ็ดยอดประกอบด้วยเจดีย์เจ็ดองค์ องค์ใหญ่ที่สุดอยู่ตรงกลางเป็นทรงสี่เหลี่ยมมีซุ้มเข้าทางทิศตะวันออก ด้านในประดิษฐานพระพุทธรูปปูนปั้นประทับนั่งขัดสมาธิเพชรปางมารวิชัย และมีเจดีย์ทรงสี่เหลี่ยมลักษณะเดียวกันแต่ขนาดเล็กอีกสี่องค์เป็นเจดีย์ประจำมุมองค์ล้อมรอบเจดีย์ประธาน และมีซุ้มทางขึ้นจากชั้นล่างในเจดีย์ประจำมุมสององค์ด้านหน้า ส่วนอีกสององค์ด้านหลังมีซุ้มประดิษฐานพระพุทธรูปทั้งสององค์ เจดีย์ทั้งห้าองค์ประดับลวดลายปูนปั้นเป็นรูปเปลวเพลิงหรือใบเสมา และด้านหน้ามีลานกว้างที่มุมทั้งสองข้างมีเจดีย์ทั้งกลมขนาดเล็กอีกสององค์ทั้งหมดรวมเป็น ๗ องค์