สำนักปฏิบัติธรรมประจำจังหวัดหรือชื่อย่อ ศธจ. เป็นหน่วยเผยแผ่พระพุทธศาสนาในรูปแบบการสอนปฏิบัติกรรมฐาน ตามหลักมหาสติปัฏฐานสูตรของคณะสงฆ์ไทย ภายใต้การกำกับของมหาเถรสมาคม ก่อตั้งครั้งแรกในปี พ.ศ. 2543 โดยใช้สำนักปฏิบัติธรรมที่มีอยู่แล้วได้รับการยกขึ้นเป็นสำนักปฏิบัติธรรมประจำจังหวัด หรือจัดตั้งขึ้นใหม่โดยคณะกรรมการจัดตั้งสำนักปฏิบัติธรรมประจำจังหวัด

วัดท่าขนุน ตำบลท่าขนุน อำเภอทองผาภูมิ ได้รับการขึ้นทะเบียนเป็นสำนักปฏิบัติธรรมประจำจังหวัดกาญจนบุรี แห่งที่ 23 ตามมติมหาเถรสมาคมที่ 488/51 ลงวันที่ 10 ตุลาคม 2551 เป็นสำนักปฏิบัติธรรมที่ทางคณะสงฆ์โดยมหาเถรสมาคมให้การส่งเสริมสนับสนุนให้วัดจัดตั้งขึ้น เพื่อรองรับประชาชนพุทธบริษัทที่สนใจใคร่ปฏิบัติธรรมด้วยการฝึกสมาธิ-เจริญวิปัสสนา วัดท่าขนุน ปัจจุบันมีพระครูวิลาศกาญจนธรรม เป็นเจ้าอาวาส (พ.ศ. 2551- ปัจจุบัน) ดำเนินการอุปสมบท บรรพชา อบรมคุณธรรมจริยธรรม ฝึกสมาธิ-เจริญวิปัสสนา ตลอดทั้งปี และได้รับการขึ้นทะเบียนเป็นสำนักปฏิบัติธรรมประจำจังหวัดดีเด่น เฉลิมพระเกียรติ พ.ศ. 2553