ถ้ำประทุนอยู่เชิงเขาทิศตะวันออก ของวัดพระพุทธบาทฯ ห่างประมาณ ๑ กิโลเมตร มีลักษณะ คล้ายกับประทุนเรือ ตรงปากถ้ำเป็นสำนักสงฆ์จีนมีพระพุทธรูปทั้งของไทยและของจีนประดิษฐานอยู่หลายองค์ นอกจากนี้ยังจัดเป็น สถานที่สงเคราะห์คนชรา ชาวจีนอีกด้วย ถ้ำนี้แบ่งเป็น ๓ ตอน มีทางเดิน ทะลุถึงกันได้ตลอด ถ้ำทางตอนเหนือมีพระพุทธรูปจีนองค์ใหญ่อยู่ตรงปากถ้ำ ถ้ำตอนกลางประดิษฐานพระพุทธรูปทั้งของไทยและของจีน ถ้ำตอนใต้มีพระเจดีย์ศิลาซึ่งพระบาทสมเด็จพระจอมเกล้าเจ้าอยู่หัวโปรดให้ นำเข้ามาจากเมืองจีน ทำทรงกลม แบบเจดีย์ลังกา และทรงบรรจุพระบรมธาตุ กับมีพระพุทธรูปศิลา อีกหลายองค์และพระพุทธรูปสำคัญคือหลวงพ่อโต ปัจจุบันมีนายผไทวัฒน์ เอลกวัฒน์ เป็นผู้จัดการมูลนิธิถ้ำประทุน
และมีพิธีการที่สำคัญจะต้องดำเนินงานในทุกปีคือพระราชพิธีสงกรานต์ จังหวัดสระบุรี พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวฯ ทรงพระกรุณาโปรดเกล้าฯ พระราชทานเครื่องราชสักการะ ที่อุทิศเป็นพุทธบูชาณ เจดียสถานและพระอารามหลวงต่าง ๆ ในจังหวัดสระบุรีจำนวน ๔ แห่ง คือพระพุทธบาทพระพุทธรูปถ้ำประทุนพระพุทธรูปถ้ำวิมานจักรี และพระพุทธฉาย